Ai Haibara stammt aus der schwarzen Organisation. Sie ist die Entwicklerin des Schrumpfgiftes APTX 4869. Als sie aus der Organisation aussteigen wollte ereilte sie das gleiche Schicksal wie Shinichi, und wurde geschrumpft. Sie gehört seitdem auch den Detective Boys an. Allerdings verhält sie sich trotz ihrer Größe sehr erwachsen. In Wirklichkeit heißt sie Shiho Miyano. In der Organisation hatte sie den Codenamen Sherry. Sie wurde von Prof. Agasa aufgenommen. Sie fürchtet sich vor der Organisation, und spürt es förmlich, wenn ein Mitglied in der Nähe ist.